Svijet bakterija

Okvirni plan rada

[osnovne informacije]

Trajanje: 6 dana (+ 1 dan za izlaganje)

Broj djece: 4-5

Prikladno za dobnu skupinu: 10-15 godina

Održano (kada i gdje): SSF, 26.7.-1.8.2009.

[opis radionice]

Cilj radionice:

??

Izvori informacija:

??

Izvođenje radionice:

Izvedba je podijeljena u 6 dana:

1. dan: Upoznavanje djece s bakterijama s osobitim naglaskom osvješćivanja da su one svuda oko nas i da postoje dobre i zle te kako komercijalne kemikalije za čišćenje tipa Domestos stvarno djeluju.

  • Moj doživljaj bakterija (Neka napišu nekoliko pojmova koji ih asociraju na bakterije te ako imaju viziju bakterije, neka ju nacrtaju.) - brainstorming prije prezentacije, na taj način propitati što znaju o bakterijama
  • Uvodno predavanje- što su bakterije, kako su građene, bakterije su druželjubiva bića, gdje ih sve možemo naći, dobre vs „zlih“
  • Koliko smo mi i stvari oko nas “čisti”? (Pohod po MEDILS-u i nasađivanje bakterija iz okoline na prethodno pripremljene petrijevke s krutim medijem. Bilo bi fora isprobati iz jogurta, iz zemlje, iz usta pa s poda, itd... Dati im na volju da ispolje svoju znatiželju.)
  • Koliko je Domestos stvarno učinkovit? (na jednu podlogu nanesemo i njega)
  • Gdje čuvamo bakterije da brže narastu? (Napraviti i jednu petrijevku koju ćemo ostaviti ovih dana da “živi” na sobnoj temperaturi, a ostale ćemo u inkubator potrpati za svaki slučaj, iako bi trebale i bez inkubatora na visokoj temperaturi narasti nakon 24h)

2. dan: Analiza dobivenih rezultata od 1.dana te poticanje istraživačkog duha sudionika tako da moraju samostalno identificirati bakterije koje su im narasle na podlozi uporabom knjiga, interneta i inih pomagala uz naše moderatorstvo (imamo pripremljenu ppt s pojmovima s kojima bi se mogli susreti prilikom potrage, a nejasni su im).

  • Što sam dobio/la? (Pogledati kakve su bakterije narasle na njihovim podlogama. Zadatak je da sami identificiraju bakterije na svojim podlogama- pretraga po knjigama i internetu uz našu pomoć) - oko 2h
  • Kako se izrađuju podloge na kojima bakterije rastu? – oko pola h, s tim da se moraju hladiti da se skruti agar (taman pauza za ručak)
  • Kako presaditi bakteriju? (neka si izaberu bakteriju koja im se najviše sviđa(a identificirali su ju) te ju presade i tijekom 3.dana brinu se za nju - rade pokuse na njoj ) – par '
  • Kako razlikovati bakterije pod mikroskopom?(Bojanje po Gramu i KOH test):objašnjenje razlike između gram + i gram – bakterija te promatranje pod mikroskopom, upoznavanje s dijelovima mikroskopa - oko 2h

3.dan: Upoznavanje s čarolijom bakterijskih metaboličkih testova. Kroz čaroliju boja upoznat će što je sve potrebno bakterijama da bi normalno funkcionirale te provjeriti jesu li bakterije otporne na lijekove.

  • Čisto praktičan (labos) pristup s moderiranjem: propitkujemo ih što misle da će se dogoditi s tom bakterijom, ako znamo da je ona to i to, i damo im onda slideove od jučer kao podsjetnike i dodatne slideove vezane uz metabolizam te rastumačimo što god im nije jasno.
  • Što je potrebno za život bakterijama? (Metabolički testovi)
  • Koliko su bakterije otporne na antibiotike? (Antibiogram)

4.dan: Da djeca s razumijevanjem savladaju osnovne pojmove i principe vezane uz praktični dio radionice kao što su metabolizam E.coli (konkretnije laktoze), što su geni i koji su odgovorni za metabolizam laktoze u E.coli.

5. i 6. dan: Odgovoriti na pitanja kako bakterije mogu svjetlucati i što s tim ima jedna meduza, protein koji se zove GFP i mnoga druga pitanja.

  • Provjeriti što smo dobili od dana prije te komentiranje rezultata i ako imaju ikakvih pitanja (1h)
  • Projekt svjetleća bakterija (pregled projekta kroz 5.-1. polovicu 6. dana)
  • Transformacija s GFP-om, YFP-om i inim bojama- kada ćemo nasađivati neka iscrtaju na podlogama što im se sviđa
  • Izraditi filter za specifične valne duljine s kojim ćemo to vidjeti.
  • Upoznavanje s Deep View-om –bioinformatičkim alatom za vizualizaciju 3D-strukture proteina(igranje s GFP-om)

[materijali]

Obavezno izosan, krpa i plamenik kao dezificijensi.

1. dan:

  • petrijevke (broj ovisi o željama za istraživanjem), mi smo pretpostavile: 2x po sudioniku + 2 za Domestos (jedna nerazrijeđeni, druga razrijeđeni jer pretpostavljamo da će nerazrijeđeni izgristi i sam agar)
  • medij (LB ili neki drugi)
  • štapići za nanošenje materijala koji su pokupili iz okoline na petrijevku
  • flomići za označavanje petrijevki (obični vodootporni)
  • alkohol, papir za brisanje i plamenik - radi dezinfekcije prostora
  • Domestos
  • inkubator

2. dan:

  • internet, knjige...
  • petrijevke: 1x po sudioniku+ 2 rezervne
  • sastojci za medij (LB ili neki drugi)
  • eze
  • flomići za označavanje petrijevki (obični vodootporni)
  • inkubator

Bojanje po gramu:

  • Kristalviolet
  • Lugolova otopina
  • 96%-tni etanol
  • Safranin ili karbol-fuksin
  • Predmetna i pokrovna stakalca
  • Svjetlosni mikroskop

KOH test

  • 3%-tna KOH
  • Predmetna stakalca

3. dan:

METILNO CRVENILO TEST

  • Pepton 7 g/L
  • Glukoza 5 g/L
  • K2HPO4 5 g/L
  • Metil crveno
  • 4+2 epruvete

SIMMONSOV CITRAT TEST

  • MgSO4 0,2 g/L
  • NH4PO4 1,0 g/L
  • K2HPO4 1,0 g/L
  • Na-citrat 2,0 g/L
  • NaCl 5,0 g/L
  • Agar 15,0 g/L
  • Bromtimol plavo 0,08 g/L
  • 4+2 epruvete

KLIGLEROV DVOSTRUKI ŠEĆER TEST

  • Mesni ekstrakt 3,0 g/L
  • Ekstrakt kvasca 3,0 g/L
  • Pepton 15,0 g/L
  • Proteoza-pepton 5,0 g/L
  • Laktoza 10,0 g/L
  • Glukoza 1,0 g/L
  • NaCl 5 g/L
  • FeSO4 0,2 g/L
  • Na-tiosulfat 0,3 g/L
  • Agar 12 g/L
  • Fenol crveno 0,024 g/L
  • 4+2 epruvete

KATALAZA TEST

  • 3%-tni vodikov peroksid
  • Predmetna stakalca

OKSIDAZA TEST

  • Ampula oksidaza reagensa (Difco)
  • Filtar papir (Whatman no.1 ili sl.)

METILEN PLAVO TEST

  • Mlijeko
  • Metilen plavo (1% otopina)
  • 4 epruvete

ANTIBIOGRAM

  • 1-2 tabletice sa antibiotikom
  • 2 Petrijevke

Napomena: Nije nužno izvesti sve navedene testove, neki su rezerva u slučaju da se stvari odvijaju brže.

4. dan:

Potreban nam je i led!!! A treba nam i neka vodena kupelj ili termoblok (termomikser).

PLAVO-BIJELA SELEKCIJA

  • Ampicilin 50 mg/L (za izradu ploča sa tim antibiotikom: krute LB-ploče s Amp)
  • Laktoza 5 g/L
  • Otopina X-Gal 20 mg/mL
  • Tekuća LB-podloga bez antibiotika
  • Kompetentne E. coli
  • Vodena otopina plazmida pBluescript
  • 4x2 + 2 ploče (5 ploča bez laktoze, 5 sa laktozom)

5. dan:

?

Mentori:

Petra Pušić (petra.pusic [at] gmail.com)

Katarina Ćuk (katarina_cuk2 [at] yahoo.de)

Kratki opis radionice:

Upoznajte se sa bakterijama! One su svuda oko nas, a postoje dobre i zle te nas zanima kako komercijalne kemikalije za čišćenje tipa Domestos stvarno djeluju.Osim toga upoznat ćemo se sa njihovim prehrambenim navikama i vidjeti da li možemo dobiti da bakterije svijetle u mraku.

Sudionici radionice:

Domina Bilač

Lota Copić

Valentina Juraga

Karlo Pavičić-Ravlic

Matej Lozić