Svijet bakterija
Okvirni plan rada
[osnovne informacije]
Trajanje: 6 dana (+ 1 dan za izlaganje)
Broj djece: 4-5
Prikladno za dobnu skupinu: 10-15 godina
Održano (kada i gdje): SSF, 26.7.-1.8.2009.
[opis radionice]
Cilj radionice:
??
Izvori informacija:
??
Izvođenje radionice:
Izvedba je podijeljena u 6 dana:
1. dan: Upoznavanje djece s bakterijama s osobitim naglaskom osvješćivanja da su one svuda oko nas i da postoje dobre i zle te kako komercijalne kemikalije za čišćenje tipa Domestos stvarno djeluju.
- Moj doživljaj bakterija (Neka napišu nekoliko pojmova koji ih asociraju na bakterije te ako imaju viziju bakterije, neka ju nacrtaju.) - brainstorming prije prezentacije, na taj način propitati što znaju o bakterijama
- Uvodno predavanje- što su bakterije, kako su građene, bakterije su druželjubiva bića, gdje ih sve možemo naći, dobre vs „zlih“
- Koliko smo mi i stvari oko nas “čisti”? (Pohod po MEDILS-u i nasađivanje bakterija iz okoline na prethodno pripremljene petrijevke s krutim medijem. Bilo bi fora isprobati iz jogurta, iz zemlje, iz usta pa s poda, itd... Dati im na volju da ispolje svoju znatiželju.)
- Koliko je Domestos stvarno učinkovit? (na jednu podlogu nanesemo i njega)
- Gdje čuvamo bakterije da brže narastu? (Napraviti i jednu petrijevku koju ćemo ostaviti ovih dana da “živi” na sobnoj temperaturi, a ostale ćemo u inkubator potrpati za svaki slučaj, iako bi trebale i bez inkubatora na visokoj temperaturi narasti nakon 24h)
2. dan: Analiza dobivenih rezultata od 1.dana te poticanje istraživačkog duha sudionika tako da moraju samostalno identificirati bakterije koje su im narasle na podlozi uporabom knjiga, interneta i inih pomagala uz naše moderatorstvo (imamo pripremljenu ppt s pojmovima s kojima bi se mogli susreti prilikom potrage, a nejasni su im).
- Što sam dobio/la? (Pogledati kakve su bakterije narasle na njihovim podlogama. Zadatak je da sami identificiraju bakterije na svojim podlogama- pretraga po knjigama i internetu uz našu pomoć) - oko 2h
- Kako se izrađuju podloge na kojima bakterije rastu? – oko pola h, s tim da se moraju hladiti da se skruti agar (taman pauza za ručak)
- Kako presaditi bakteriju? (neka si izaberu bakteriju koja im se najviše sviđa(a identificirali su ju) te ju presade i tijekom 3.dana brinu se za nju - rade pokuse na njoj ) – par '
- Kako razlikovati bakterije pod mikroskopom?(Bojanje po Gramu i KOH test):objašnjenje razlike između gram + i gram – bakterija te promatranje pod mikroskopom, upoznavanje s dijelovima mikroskopa - oko 2h
3.dan: Upoznavanje s čarolijom bakterijskih metaboličkih testova. Kroz čaroliju boja upoznat će što je sve potrebno bakterijama da bi normalno funkcionirale te provjeriti jesu li bakterije otporne na lijekove.
- Čisto praktičan (labos) pristup s moderiranjem: propitkujemo ih što misle da će se dogoditi s tom bakterijom, ako znamo da je ona to i to, i damo im onda slideove od jučer kao podsjetnike i dodatne slideove vezane uz metabolizam te rastumačimo što god im nije jasno.
- Što je potrebno za život bakterijama? (Metabolički testovi)
- Koliko su bakterije otporne na antibiotike? (Antibiogram)
4.dan: Da djeca s razumijevanjem savladaju osnovne pojmove i principe vezane uz praktični dio radionice kao što su metabolizam E.coli (konkretnije laktoze), što su geni i koji su odgovorni za metabolizam laktoze u E.coli.
5. i 6. dan: Odgovoriti na pitanja kako bakterije mogu svjetlucati i što s tim ima jedna meduza, protein koji se zove GFP i mnoga druga pitanja.
- Provjeriti što smo dobili od dana prije te komentiranje rezultata i ako imaju ikakvih pitanja (1h)
- Projekt svjetleća bakterija (pregled projekta kroz 5.-1. polovicu 6. dana)
- Transformacija s GFP-om, YFP-om i inim bojama- kada ćemo nasađivati neka iscrtaju na podlogama što im se sviđa
- Izraditi filter za specifične valne duljine s kojim ćemo to vidjeti.
- Upoznavanje s Deep View-om –bioinformatičkim alatom za vizualizaciju 3D-strukture proteina(igranje s GFP-om)
[materijali]
Obavezno izosan, krpa i plamenik kao dezificijensi.
1. dan:
- petrijevke (broj ovisi o željama za istraživanjem), mi smo pretpostavile: 2x po sudioniku + 2 za Domestos (jedna nerazrijeđeni, druga razrijeđeni jer pretpostavljamo da će nerazrijeđeni izgristi i sam agar)
- medij (LB ili neki drugi)
- štapići za nanošenje materijala koji su pokupili iz okoline na petrijevku
- flomići za označavanje petrijevki (obični vodootporni)
- alkohol, papir za brisanje i plamenik - radi dezinfekcije prostora
- Domestos
- inkubator
2. dan:
- internet, knjige...
- petrijevke: 1x po sudioniku+ 2 rezervne
- sastojci za medij (LB ili neki drugi)
- eze
- flomići za označavanje petrijevki (obični vodootporni)
- inkubator
Bojanje po gramu:
- Kristalviolet
- Lugolova otopina
- 96%-tni etanol
- Safranin ili karbol-fuksin
- Predmetna i pokrovna stakalca
- Svjetlosni mikroskop
KOH test
- 3%-tna KOH
- Predmetna stakalca
3. dan:
METILNO CRVENILO TEST
- Pepton 7 g/L
- Glukoza 5 g/L
- K2HPO4 5 g/L
- Metil crveno
- 4+2 epruvete
SIMMONSOV CITRAT TEST
- MgSO4 0,2 g/L
- NH4PO4 1,0 g/L
- K2HPO4 1,0 g/L
- Na-citrat 2,0 g/L
- NaCl 5,0 g/L
- Agar 15,0 g/L
- Bromtimol plavo 0,08 g/L
- 4+2 epruvete
KLIGLEROV DVOSTRUKI ŠEĆER TEST
- Mesni ekstrakt 3,0 g/L
- Ekstrakt kvasca 3,0 g/L
- Pepton 15,0 g/L
- Proteoza-pepton 5,0 g/L
- Laktoza 10,0 g/L
- Glukoza 1,0 g/L
- NaCl 5 g/L
- FeSO4 0,2 g/L
- Na-tiosulfat 0,3 g/L
- Agar 12 g/L
- Fenol crveno 0,024 g/L
- 4+2 epruvete
KATALAZA TEST
- 3%-tni vodikov peroksid
- Predmetna stakalca
OKSIDAZA TEST
- Ampula oksidaza reagensa (Difco)
- Filtar papir (Whatman no.1 ili sl.)
METILEN PLAVO TEST
- Mlijeko
- Metilen plavo (1% otopina)
- 4 epruvete
ANTIBIOGRAM
- 1-2 tabletice sa antibiotikom
- 2 Petrijevke
Napomena: Nije nužno izvesti sve navedene testove, neki su rezerva u slučaju da se stvari odvijaju brže.
4. dan:
Potreban nam je i led!!! A treba nam i neka vodena kupelj ili termoblok (termomikser).
PLAVO-BIJELA SELEKCIJA
- Ampicilin 50 mg/L (za izradu ploča sa tim antibiotikom: krute LB-ploče s Amp)
- Laktoza 5 g/L
- Otopina X-Gal 20 mg/mL
- Tekuća LB-podloga bez antibiotika
- Kompetentne E. coli
- Vodena otopina plazmida pBluescript
- 4x2 + 2 ploče (5 ploča bez laktoze, 5 sa laktozom)
5. dan:
?
Mentori:
Petra Pušić (petra.pusic [at] gmail.com)
Katarina Ćuk (katarina_cuk2 [at] yahoo.de)
Kratki opis radionice:
Upoznajte se sa bakterijama! One su svuda oko nas, a postoje dobre i zle te nas zanima kako komercijalne kemikalije za čišćenje tipa Domestos stvarno djeluju.Osim toga upoznat ćemo se sa njihovim prehrambenim navikama i vidjeti da li možemo dobiti da bakterije svijetle u mraku.
Sudionici radionice:
Domina Bilač
Lota Copić
Valentina Juraga
Karlo Pavičić-Ravlic
Matej Lozić